YUVA kurulduğu günden bu yana ulusal ve uluslararası birçok kurumla işbirliği kurmuştur. Halihazırda devam eden projeleri dahil olmak üzere Malala Fonu, Avrupa İklim Derneği (ECF), Uluslararası Göç Organizasyonu (IOM), Birleşmiş Milletler Mülteciler Yüksek Komiserliği (UNHCR), Alman Uluslararası İşbirliği Derneği (GIZ), İsviçre Göç Devlet Sekreterliği, Finlandiye Dışişleri Bakanlığı, The Ashmore Foundation, DVV International, Danimarka Mülteci Konseyi (DRC), Save the Children, Goethe Enstitüsü, Birleşik Devletler Dışişleri Bakanlığı Göç, Mülteci ve Nüfus Bürosu (BPRM), Vehbi Koç Vakfı, Sabancı Vakfı gibi çeşitli kurumlarla operasyonlar yürütülmüş ve yürütülmektedir.
Yuva Derneği 2015 yılından bu yana Avrupa Yetişkin Eğitimi Derneği (EAEA) üyesidir. Aynı zamanda Sürdürülebilir Çözümler Ağı (SDSN), Network for Empowered Aid Response (NEAR), Europe Beyond Coal, CIVICUS, Ulusal Gönüllülük Komitesi ve Küresel Okuryazarlık Ağı (KOZA) platformlarının da mensubudur.
YUVA, faaliyet gösterdiği alanlarla ilgili ulusal ya da uluslararası sponsor ve donörlerle ortak proje geliştirmeye veya işbirliğine daima açıktır.

